上海交通大學醫學院附屬第九醫院整復外科成立于1961年6月，是我國整復外科和修復重建外科的發源地之一。學科創始人張滌生院士，是我國整復外科主要的創建者，顯微外科的開拓者和顱面外科的奠基者。現任科主任李青峰教授，為國家長江學者特聘教授、國家杰出青年科學基金獲得者。學科定位為：“綜合實力在亞太地區居領跑地位，部分優勢項目居國際優等水平”的優等整形外科醫、教、研中心。
學科是全國整形外科較早的重點學科（1984）和博士學位授予點（1984），1991年成為博士后流動站職業學科點，目前為上海市（重中之重）重點學科。學科是上海市整復外科研究所所在地，具備比較齊全的基礎研究條件，設有顯微外科實驗室、顱面外科三維數字實驗室、瘢痕實驗室，和淋巴水腫實驗室，新設立了組織再生與構建實驗室、血管瘤與血管畸形實驗室。經過50年的發展和近年來的建設，已成為門類齊全，科研和臨床并舉，在全國整復外科領域甚至國際上具有重要影響的學科，是我國迄今現有的顱面外科和淋巴水腫綜合治療中心。
經過老中青三代人孜孜不倦地努力耕耘，學科打造了一支團結奮進，探索求新的學術隊伍，擁有王煒、關文祥、黃文義、朱昌、馮勝之等一批知名專家和教授。學科多年來是進修醫師培訓基地，已培訓進修醫生數千名，其中許多已成為各地整復外科領域的主要學術帶頭人。學科積極開展國內外學術交流，與美國、加拿大、法國、意大利、日本、韓國及港、澳、臺地區知名大學、研究所建立了科研合作關系，醫生互訪。常年舉辦大型國際會議及全國性學術交流，為我國整形外科與世界優等水平接軌，培養高層次職業人才作出了巨大貢獻。
學科設有南北二部、浦東分院和3個門診部，病床240余張。學科設置顯微重建、顱面外科、血管瘤與畸形專科、淋巴專科、手外科、燒傷整形外科和美容外科七大專科，包括面神經癱瘓、泌尿生殖系畸形、激光、植發、功能康復等20個職業方向。現有教授、主任醫師等高等職稱50人，各級臨床醫師116名，年門診量25萬人次，年手術與治療6萬4千余人次。
近3年累計獲國家自然科學基金重點項目、國家十二五支撐計劃、“863”子項目等國家重點項目，國家自然基金36項，發表SCI論文143篇，其中IF5分以上文章16篇。學科獲得國家科技進步獎、科技成果獎及上海市科技進步獎。
自2009年起，連續8年獲復旦大學《年度中國很優等醫院及很優等專科聲譽排行榜》全國 前列。2014年起，連續三年獲中國醫學科學院醫院科技競爭力排行整形外科全國 前列
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